Identification of prognostic and bone metastasis​-related alternative splicing signatures in mesothelioma

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कैंसर की दवा 2021 मई 26 [लिंक]

Runzhi Huang, Zixuan Zheng, सिजिया लियू, पेनघुई यान, डियानवेन गीत, हुआबिन यिन, पेंग हू, ज़ियाओलॉन्ग झू, ज़ेंग्यान चांग, ​​यिहान लियू, जुआनवेई झुआंग, टोंग मेन्ग, ज़ोंगकियांग हुआंग, जी झांग सार

Mesothelioma (MESO) Pleura, Peritoneum, Pericardium, और ट्यूनिका Vaginalis टेस्टिस की मेसोथेलियल कोशिकाओं से व्युत्पन्न ट्यूमर है। प्रौद्योगिकियों में प्रगति के बावजूद और ट्यूमर प्रगति तंत्र की बेहतर समझ, मेसो की पूर्वानुमान गरीब बनी हुई है। ऑनकोजनिसिस, ट्यूमर मेटास्टेसिस और दवा प्रतिरोध में वैकल्पिक स्प्लिसिंग इवेंट्स (एएसईएस) की भूमिका व्यापक रूप से कई कैंसर में चर्चा की गई है। लेकिन एमएसओ में एएसईएस के पूर्वानुमान और संभावित चिकित्सीय मूल्य का स्पष्ट रूप से अध्ययन नहीं किया गया था। हमने आरएनए अनुक्रमण डेटा का उपयोग करके एक पूर्वानुमानित मॉडल का निर्माण किया और टीसीजीए और टीसीजीएएसपीएलआईसीईक्यू डेटाबेस से प्राप्त मेसो रोगियों के एएसई डेटा का मिलान किया। कुल 3,993 एएसई को कॉक्स रिग्रेशन विश्लेषण का उपयोग करके समग्र अस्तित्व से जुड़े पहचाने गए थे। उनमें से आठ अंततः लासो रिग्रेशन विश्लेषण द्वारा मॉडल को स्थापित करने के लिए निकाले गए थे। मॉडल का जोखिम स्कोर स्वतंत्र रूप से पूर्वानुमान की भविष्यवाणी कर सकता है। पहचान की गई 3 9 0 स्प्लिसिंग कारकों (एसएफ), एचएसपीए 1 ए और डीडीएक्स 3 वाई में 43 ओएस-एसईएस के साथ काफी जुड़ा हुआ था। इन ओएस-एसईएस, एसएनएक्स 5-58744-पर (पी = 0.048) और एसएनएक्स 5-58745-एटी (पी = 0.048) में हड्डी मेटास्टेसिस से काफी जुड़े हुए थे। सिग्नल पथ और एसएनएक्स 5-58744-एटी के सह-अभिव्यक्ति विश्लेषण, एसएनएक्स 5-58745-एटी को जीएसवीए का उपयोग करके भी दर्शाया गया था। आखिरकार, हमने प्रस्तावित किया कि स्प्लिसिंग फैक्टर (एसएफ) एचएसपीए 1 ए पथ के माध्यम से snx5-58744-at (r = -0.414) पर (r = 0.414) को नियंत्रित कर सकता है "कक्षा I एमएचसी मध्यस्थ एंटीजन प्रसंस्करण और प्रस्तुति" (आर) = 0.400)। इस तरह, मेसो के ट्यूमरिजनोसिस और हड्डी मेटास्टेसिस को नियंत्रित किया गया था।

प्रोजेस्टोस्टिक और हड्डी मेटास्टेसिस की पोस्ट पहचान - मेसोथेलियोमा में अपने वैकल्पिक स्प्लिसिंग हस्ताक्षर पहली बार मेसोथेलियोमा लाइन पर दिखाई दीं।

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